Købmandsgården drives ifølge Viborg Stifts Folkeblad som socialøkonomisk virksomhed og kunderne betjenes af fleksjobbere.
Skelhøje Købmandsgaard tilbyder også kunder afhentning af receptpligtig medicin fra apoteket hver dag efter syv, hvis man beder lægen om at sende medicinen til Skelhøje Købmandsgaard.
Desuden har købmandsgården en café.